Все о чакре
Для большей части техник использование ниндзюцу требует использование внутренней энергии - чакры. Существует два источника чакры: первый - внутренняя энергия миллиардов клеток в теле, второй - физическая и ментальная энергия, которая накапливается в результате ментальных и физических тренировок. Увеличивается она благодаря преодолению сложных жизненных ситуаций.

Чтобы применить технику, шиноби должен уметь контролировать и высвобождать эти виды энергии. Количество чакры, поглощаемое техниками зависит от их сложности и мастерства самого шиноби. Чем опытнее шиноби, тем меньше энергии он тратит на одно и то же дзюцу. В тайцзюцу (рукопашный бой) нет необходимости в использовании чакры, так как большая часть атак базируется на физических возможностях тела шиноби. В ниндзюцу затраты энергии зависят от способностей исполнителя к контролю над чакрой. У ниндзя с совершенным самоконтролем вся энергия будет использоваться прямо по назначению. Новички же тратят неоправданно большое количество чакры даже на простые дзюцу.

Потоки чакры определяются системой ее циркуляции в теле. Существует большое количество тончайших каналов, соединяющих жизненно важные точки. С помощью этих каналов шиноби может перераспределять чакру внутри своего тела. Если каким-то образом каналы вдоуг оказываются разорванными, даже опытнейшому медику становится очень сложно их восстановить.

Система циркуляции чакры распространяется на все внутренние органы и включает в себя 361 тенкетсу (своеобразные узлы, которые связывают между собой каналы протекания энергии). Манипулируя тенкетсу ниндзя может принудительно усиливать или ослаблять потоки чакры. Лишь шиноби, который владеет техникой Бьякогана может видеть систему циркуляции энергии другого человека.

Шаринган позволяет своему обладателю увидеть лишь основные потоки чакры, но не всю систему. Комбинация из Бьякогана и специального тайцзюцу известного клана Хьюго позволяет его представителям атаковать тенкетсу противника. После таких атак поток чакры через тенкетсу блокируется и ниндзя теряет способность использовать техники. Кроме того, атаки представителей клана Хьюго повреждают не только тенкетсу, но и внутренние органы. Поскольку ниндзя не имеет возможности усиливать внутренние органы наравне с мускулами, подобные атаки крайне опасны.

Использование чакры
Концентрируя определенное количество чакры на ногах, ниндзя способны прикреплять свое тело к любой поверхности - к дереву, стене и т.п. Также эта способность дает им возможность перемещаться по любой местности - гулять по вертикальной стене словно по земле. Навыки хотьбы по воде сложнее в изучении, потому как требует лучшего контроля над чакрой.

Кроме того, концентрируя энергию в мускулах, ниндзя способен временно увеличить свою силу и выносливость. Помимо всего прочего, чакра активно используется в бою. Например, Канкуро создает тончайшие энергетически нити для управления своими марионетками, а Кабуто с ее помощью создает невидимые скальпели, режущие внутренние органы противника. Кроме того, при помощи чакры создаются защитные барьеры.

Любое гендзюцу базируется на внедрении своей чакры в разум и органы чувств противника. После этого шиноби получает практически неограниченные способности по контролю над попавшим в технику соперником. Существует всего две возможности нейтрализовать гендзюцу. В первом случае шиноби должен полностью остановить поток чакры в своем теле. Во втором - попавшему в гендзюцу ничего не остается, кроме как рассчитывать на помощь товарищей, которые могут разрушить иллюзии своей энергией.